我们需要明确一点，支付宝作为一家第三方支付平台，并不具备起诉的权利。如果在使用支付宝时发生纠纷，一般情况下，双方可以通过协商解决。支付宝会提供客服支持，帮助用户解决问题。但是，如果涉及到法律问题，支付宝会配合相关部门进行调查，并提供必要的证据。

如果您在使用支付宝时遇到了金额较大的纠纷，比如1000元以上的金额，建议您及时与对方进行沟通，并保留相关的证据。如果无法通过协商解决，可以考虑向相关部门投诉，比如工商部门或者消费者协会。他们会根据相关法律法规进行处理，并维护您的权益。

另外，支付宝也有一定的风控机制，可以帮助用户识别风险交易。如果您发现有可疑的交易行为，可以及时联系支付宝客服进行报告，他们会帮助您处理风险交易，并保障您的资金安全。

支付宝作为一家第三方支付平台，会尽力保障用户的权益，但是也需要用户自身提高警惕，保护个人信息和资金安全。在使用支付宝时，建议您遵守相关规定，避免发生纠纷。如果遇到问题，及时与支付宝客服联系，寻求帮助解决。

支付宝不会因为1000元起诉用户，但是在使用支付宝时，用户需要提高警惕，保护个人信息和资金安全。如遇纠纷，可以通过协商、投诉等方式解决问题。