支付宝借呗的逾期还款是有一定法律依据的。根据《合同法》第114条规定，借款人应当按照约定的期限和方式履行还款义务，未履行还款义务的，应当支付违约金。因此，如果借呗用户逾期还款，支付宝有权采取合法手段追讨欠款。

然而，是否会被起诉取决于具体的情况。一般来说，借呗欠5万逾期3年，支付宝有可能选择通过法律途径来追讨债务。但是，是否会起诉还要考虑以下几个因素：

1. 欠款金额：欠款金额较小的情况下，支付宝可能倾向于通过信用等级降低、催收等方式来解决问题，而不会采取起诉的手段。但如果欠款金额较大，支付宝可能会选择通过法律手段来追讨债务。

2. 欠款时间：逾期时间越长，追讨欠款的可能性也越大。如果借呗用户逾期3年，支付宝有足够的时间和理由来考虑采取法律手段追讨欠款。

3. 借款人的还款意愿和能力：如果借呗用户在逾期期间积极与支付宝沟通，并有还款的意愿和能力，支付宝可能会选择协商解决，而不采取起诉的方式。但如果借款人没有还款意愿和能力，支付宝可能会选择起诉追讨债务。

需要注意的是，以上只是一般情况的判断依据，具体是否会被起诉还要考虑借呗用户的信用状况、支付宝的追债策略等因素。在实际操作中，支付宝也会根据具体情况来决定是否采取起诉等法律手段。

如果借呗欠款5万逾期3年，有一定的可能性会被支付宝起诉追讨债务。但具体是否会起诉还要考虑欠款金额、欠款时间以及借款人的还款意愿和能力等因素。为了避免出现这种情况，借呗用户应当按时还款，并与支付宝保持沟通，协商解决逾期问题。